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Nipype(四):Interfaces
Interfaces在之前已经学习过Interfaces的基本概念和操作,这里简单介绍一下。Interfaces就是其他软件包的python函数接口,想要使用其他软件的(例如FSL,SPM或者FreeSurfer)函数,就需要此函数的python接口... -
Nipype(三):Quickstart
Nipype Quickstart首先需要Import所需要的函数和包 import os from os.path import abspath from nipype import Workflow, Node, MapNode, Funct... -
Nipype(二):showcase
Nipype Showcase使用简单的fMRI预处理流程来展示Workflow: slice time correction motion correction smoothing 准备预处理workflow首先导入Nipype包中的Node和... -
神经影像(一):Nipype库学习
Nipype简介Nipype是一个开源神经影像处理软件包,使用python编写。整合了传统神经影像处理软件包的接口(SPM,FSL,FreeSurfer,AFNI以及其他),可以使研究人员通过不同的软件处理图像,将其整合在一起。 比如你想使用SPM做... -
核磁共振原理(五):K空间
K空间和傅里叶变换在之前的学习中一直参考的是《磁共振成像技术指南》这本书,但是看书还是无法理解K空间和相位编码部分的知识。在网上找了一些资料看了一下,决定看看这部分数学推导,这样应该可以帮助理解。 K空间数学原理在主磁场的+z方向上的梯度磁场激发下,... -
核磁共振原理(四)
磁共振的空间定位地球上的纬度的定位依靠地磁梯度,实际上磁共振信号的三维空间定位也是利用三套梯度线圈产生的梯度磁场来实现的。MR信号的空间定位包括层面层厚的选择、频率编码、相位编码。 层面和层厚的选择在1.5T场强下,质子进动频率约为64MHZ。在Z轴... -
核磁共振原理(三)
磁共振加权成像加权是“突出重点”的意思,组织的多方面特性均可能对其磁共振信号的强弱有影响,我们可以通过成像脉冲序列的选择及成像参数的调整,使MR图像主要反映组织某方面特性,而尽量抑制组织的其他特性对MR信号强度的影响。 TI加权成像(T1-weigh... -
核磁共振原理(二)
核磁共振物理学原理 原子结构 原子由原子核和围绕原子核的电子构成,原子核中有中子和质子,中子不带电,质子带正电。 自旋和核磁 原子核具有一定大小和质量,可以视作一个球体,所有磁性原子核都有一个特性,就是总以一定的频率绕着自己的轴进行高速旋转,原子核这... -
核磁共振原理(一)
核磁共振仪的硬件组成 核磁共振仪主要由主磁体、梯度系统、射频系统、计算机系统和其他辅助设备。 主磁体 主磁体分为永磁型和电磁型,永磁性产生的磁场强度通常比电磁型小,电磁型可以产生很大的磁场强度。 主要参数 磁场强度:磁场强度的单位... -
告别
毕业大学四年过去了,回顾一下这四年还挺美好的,虽然没社交没参加活动啥的,感觉那都是虚的,真正要提高的还是自己的做工程的能力和精神。最害怕的是转专业后也沦为做题机器了,幸好没有,做了几个还算一般的项目吧。最后一年我也不知道为啥摆烂了,因为疫情?肯定不是...